MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW5

Total Repeats: 20018

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017953	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859449
2	NC_017953	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	389859449
3	NC_017953	TAA	3	9	93	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859449
4	NC_017953	GTA	2	6	137	142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
5	NC_017953	AGT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
6	NC_017953	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	389859449
7	NC_017953	CAA	2	6	338	343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859449
8	NC_017953	AGT	2	6	364	369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
9	NC_017953	GTG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859449
10	NC_017953	CAG	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859449
11	NC_017953	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	389859449
12	NC_017953	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	389859449
13	NC_017953	GCC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389859449
14	NC_017953	TGC	2	6	663	668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859449
15	NC_017953	ATT	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859449
16	NC_017953	CGA	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859449
17	NC_017953	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	389859449
18	NC_017953	TAT	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859449
19	NC_017953	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	389859449
20	NC_017953	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859449
21	NC_017953	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859449
22	NC_017953	AGA	2	6	969	974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859449
23	NC_017953	CAA	2	6	1042	1047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859449
24	NC_017953	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	389859449
25	NC_017953	TTG	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859449
26	NC_017953	CTC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859449
27	NC_017953	GAT	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
28	NC_017953	GAT	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
29	NC_017953	GAAGGA	2	12	1360	1371	50 %	0 %	50 %	0 %	389859449
30	NC_017953	ATG	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
31	NC_017953	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	389859449
32	NC_017953	CCT	2	6	1552	1557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859449
33	NC_017953	CTT	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859449
34	NC_017953	CAG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859449
35	NC_017953	TGA	2	6	1739	1744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859449
36	NC_017953	ATG	2	6	1936	1941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859450
37	NC_017953	GTG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859450
38	NC_017953	TCC	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859450
39	NC_017953	AGC	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859450
40	NC_017953	T	6	6	1984	1989	0 %	100 %	0 %	0 %	389859450
41	NC_017953	AGC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859450
42	NC_017953	AAG	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859450
43	NC_017953	TAC	2	6	2041	2046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859450
44	NC_017953	GCT	2	6	2051	2056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859450
45	NC_017953	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	389859450
46	NC_017953	AAC	2	6	2149	2154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859450
47	NC_017953	AGA	2	6	2161	2166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859450
48	NC_017953	AGA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859451
49	NC_017953	ATC	2	6	2424	2429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859451
50	NC_017953	TGC	2	6	2444	2449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859451
51	NC_017953	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	389859451
52	NC_017953	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	389859451
53	NC_017953	CAT	2	6	2568	2573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859451
54	NC_017953	AGA	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859451
55	NC_017953	AAG	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859451
56	NC_017953	GGA	2	6	2661	2666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859451
57	NC_017953	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	389859452
58	NC_017953	ATC	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859452
59	NC_017953	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	389859452
60	NC_017953	ATA	2	6	2940	2945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859452
61	NC_017953	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389859452
62	NC_017953	GGT	2	6	3019	3024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859452
63	NC_017953	AAT	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859452
64	NC_017953	TTC	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859452
65	NC_017953	GCA	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
66	NC_017953	GGA	2	6	3227	3232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859452
67	NC_017953	CAG	2	6	3246	3251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
68	NC_017953	GTT	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859452
69	NC_017953	GGT	2	6	3355	3360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859452
70	NC_017953	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	389859452
71	NC_017953	T	6	6	3428	3433	0 %	100 %	0 %	0 %	389859452
72	NC_017953	AAG	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
73	NC_017953	ATT	2	6	3575	3580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859452
74	NC_017953	TTG	2	6	3627	3632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859452
75	NC_017953	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	389859452
76	NC_017953	AAG	2	6	3738	3743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
77	NC_017953	AAG	2	6	3753	3758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
78	NC_017953	CAG	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
79	NC_017953	GCT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859452
80	NC_017953	TGTGA	2	10	3881	3890	20 %	40 %	40 %	0 %	389859452
81	NC_017953	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	389859452
82	NC_017953	AAG	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859452
83	NC_017953	CAG	2	6	4082	4087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859452
84	NC_017953	GGA	2	6	4169	4174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859452
85	NC_017953	AAT	2	6	4179	4184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389859452
86	NC_017953	TTGAA	2	10	4237	4246	40 %	40 %	20 %	0 %	389859453
87	NC_017953	ATT	2	6	4259	4264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859453
88	NC_017953	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859453
89	NC_017953	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	389859453
90	NC_017953	GTA	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859453
91	NC_017953	GAGAA	2	10	4531	4540	60 %	0 %	40 %	0 %	389859453
92	NC_017953	AGA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859453
93	NC_017953	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	389859453
94	NC_017953	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859453
95	NC_017953	CGT	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859453
96	NC_017953	A	7	7	4928	4934	100 %	0 %	0 %	0 %	389859453
97	NC_017953	GTT	2	6	4935	4940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859453
98	NC_017953	GAAAA	2	10	4968	4977	80 %	0 %	20 %	0 %	389859453
99	NC_017953	A	7	7	4974	4980	100 %	0 %	0 %	0 %	389859453
100	NC_017953	TGA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859453
101	NC_017953	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	389859453
102	NC_017953	TTACA	2	10	5123	5132	40 %	40 %	0 %	20 %	389859453
103	NC_017953	TTG	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859453
104	NC_017953	TTC	2	6	5308	5313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859453
105	NC_017953	TCT	2	6	5400	5405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859453
106	NC_017953	AGA	2	6	5420	5425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859453
107	NC_017953	GTT	2	6	5447	5452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389859453
108	NC_017953	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	389859453
109	NC_017953	GGT	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859453
110	NC_017953	AAAGCT	2	12	5541	5552	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	389859453
111	NC_017953	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	389859453
112	NC_017953	CTC	2	6	5599	5604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389859453
113	NC_017953	AGC	2	6	5630	5635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859453
114	NC_017953	ATT	2	6	5747	5752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389859454
115	NC_017953	TCT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389859454
116	NC_017953	GCT	2	6	5811	5816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859454
117	NC_017953	GTCTT	2	10	5817	5826	0 %	60 %	20 %	20 %	389859454
118	NC_017953	GAT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389859454
119	NC_017953	TC	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	389859454
120	NC_017953	GA	3	6	5873	5878	50 %	0 %	50 %	0 %	389859454
121	NC_017953	ACG	2	6	5884	5889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389859454
122	NC_017953	GAA	2	6	5908	5913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
123	NC_017953	TGGA	2	8	5921	5928	25 %	25 %	50 %	0 %	389859454
124	NC_017953	AT	3	6	5977	5982	50 %	50 %	0 %	0 %	389859454
125	NC_017953	AGA	3	9	5985	5993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
126	NC_017953	GCT	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389859454
127	NC_017953	AGA	2	6	6003	6008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
128	NC_017953	TGG	2	6	6039	6044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389859454
129	NC_017953	AGA	3	9	6057	6065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389859454
130	NC_017953	GGA	2	6	6066	6071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859454
131	NC_017953	TG	3	6	6130	6135	0 %	50 %	50 %	0 %	389859454
132	NC_017953	T	6	6	6208	6213	0 %	100 %	0 %	0 %	389859454
133	NC_017953	TCA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389859454
134	NC_017953	GGA	2	6	6288	6293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389859454
135	NC_017953	CTTT	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	389859454
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